ČR je tiež členom SEPA, takže aj pre ňu platia rovnaké pravidlá. Aj keď na rozdiel od SR, kde sú plne implementovamné aj pre domáci platobný stak (IBAN číslo účtu už 3 mesiace používame aj na domáce platby, nielen pre zahraničné), tak krajiny nevyužívajúce Euro sú povinné plnú implementáciu vykonať do roku 2016.
Takže sa treba informovať u svojej banky, či SEPA pravidlá už implementovala, alebo nie. U nás to banky riešili postupne - bezplatný (resp. na úrovni poplatku za domáci prevod) sa dalo prevádzať v rámci bánk rovnakej skupiny - teda z VÚB do bánk Intesa BCI, zo Sporiteľne do bánk skupiny Erste a pod. už v minulosti. A podľa vyššie uvedených príspevkov to už umožňujú aj niektoré české banky.